当館は昭和42年に神戸商船大学海事資料館として開館しました。所蔵・展示品は広く海事一般に関する資料であり、和船や西洋型帆船の模型、航海用具、レシプロ機関の模型など多岐にわたります。中でも大小約20隻の和船模型をはじめとする和船関連の資料は、すでに姿を消してしまった和船の部分実物、船大工の画いた板図や道具類、船頭達の使用した器具、海路図や奉納絵馬など、他に類例を見ない貴重な蒐集品であるといえます。また、海の日を記念して、毎年７月中旬から10月末の間に企画展を開催して特別展示を行っています。ご来館の皆様をボランティア・スタッフが解説を交えながらご案内します。さらに、練習船深江丸（ふかえまる：449G/T、全長50ｍ）がキャンパス内に停泊しているときは、船内見学も可能です。（要事前確認・予約）

当館は毎年７月中旬から10月末日にかけて企画展を開催し、常設展示に加えて特別展示を行います。また、10月から11月にかけて、毎週土曜日の午後に全５回の海事博物館市民セミナーを開催します。